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新型变异毒株奥密克戎

Immundiagnostik MutaPLEX®新型冠状病毒核酸检测试剂(货号:KG192696)的标准筛查PCR涵盖了所有先前描述的突变,包括新发现的新冠病毒变种奥密克戎。
后续突变可使用MutaPLEX®CoV-2 MUT 3 (货号:KG193396)或MutaPLEX®CoV-2 MUT 2(货号:KG193296)进行检测。除了目前占主导地位的Delta变异毒株外,还可以检测到全新的高度可变的需要高度关注的变异株(variations of concern, VoCs),例如来自南非的当前亚型奥密克戎。
 
MutaPLEX@新冠病毒核酸检测试剂(MutaPLEX@ Coronavirus real time RT-PCR kit)(Immundiagnostik AG,货号:KG1926xx
MutaPLEX@呼吸筛查1实时RT-PCR试剂(Immundiagnostik AG,货号:KG1927xx)
MutaPLEX@呼吸筛查2 DIFF实时RT-PCR试剂(Immundiagnostik AG,货号:KG1928xx)
MutaPLEX@SC2多基因实时RT-PCR试剂(Immundiagnostik AG,货号:KG1930xx)
MutaPLEX@新冠病毒4G实时RT-PCR试剂(Immundiagnostik AG,货号:KG1936xx)
 
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)棘突蛋白基因突变对检测的影响:
在Immundiagnostik AG的生物信息学分析中,对全球基因库(NCBI)和GISAID(EpiCovTM)全球数据库中的可用序列进行了以下棘突蛋白基因突变分析。
以下突变包括高关注变异株(Variants of Concern ,VOC)和须留意变异株(Variants of Interest, VOI)
VOC: B.1.1.7 [Alpha]*, B.1.351 [Beta], P.1/B.1.1.28 [Gamma], B.1.617.2 [Delta], AY.4.2 [Delta]
VOl: B.1.429 [Epsilon]*, B.1.427 [Epsilon]*, P.2 [Zeta]*, B.1.525 [Eta]*, P.3 [Theta]*, B.1.526 [lota]*, B.1.617.1 [Kappa]*, C.37 [Lambda], B.1.621 [Mu], AY.4.2 [...] B.1.1.529 [Omicron]
*降级变异至少符合以下标准之一:(1)变异不再传播;(2)变异已经传播很长时间,对整体流行病学情况没有任何影响;(3)科学证据表明变异与任何相关属性无关。(ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern)
 
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)棘突蛋白突变:
L18F, H66D, A67V, △69/70, G75V, T76I, D80A, T95I, G142V, △141, △142, △143, △144, Y144F, Y145D, △157/158, △211, L212I, ins214EPE, D215G, 0241/243, △247/253, P3375, F338L, G339D, V341I, F342L, A3445, A348S, N354D, A352S, S359N, V367F, N370S, S371L, A372T, A372S, 5373P, S375F, F377L, K378N, K378R, P384L, T385A, T393P, V395I, D405V, E406Q, R408I, Q409E, Q414R, Q414A, Q414E, K417N, K417T, A435S, W436R, N439K, N440K, K444R, V445F, G446V, G446S, L452R, L452Q, Y453F, F456L, F456E, K458R, K458Q, E471Q, I472V, G476S, S477R, S477I, S477N, T478l, T478K, P479S, N481D, G482S, V483A, V483I, E484K, E484Q, E484A, G485S, F4865, F490S, Q493R, S494P, G496S, Q498R, P499R, N501Y, V503F, Y505C, Y508H, A520V, A520S, P521S, P521R, A522V, A522S, T547K, D614G, H655Y, G669S, Q677H, N679K, P681H, P681R, R683A, R685A, A701V, N764K, D796Y, F817P, N856K, A892P, A899P, A942P, Q949R, Q954H, N969K, L981F, K986P, V987P, D1118H, V1176F, N1 187D
 
所列突变不影响所命名的核酸检测的敏感性和特异性。
发布地点和日期:Bensheim, 2021.11.26
分子生物学负责人:Dr. Wolfgang Reichert
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